Gracias por el aporte, Alma Negra. Lo he probado y le veo algunas pegas: No te permite elegir entre los diferentes caracteres equivalentes a una letra de nuestro alfabeto (él decide si usa por ejemplo omicron u omega). También te puedes olvidar de los diferentes acentos que tiene el griego.
He buscado un poco y he encontrado esto:
http://www.lexilogos.com/keyboard/greek_ancient.htm
Hace lo mismo que el tuyo pero además tienes el alfabeto griego debajo, con todos los acentos, para corregir.
Como dicen arriba no es fiable para escribir la palabra en castellano y darla por buena pero para hacer apuntes copiando la palabra del libro de texto viene bien.
Claro que para eso la solución más sencilla es buscar la palabra en la wikipedia y copypastearla, en griego, en los apuntes... :-/